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応用物理学会には、日本光学会、放射線、応用電子物性、薄膜・表面物理、結晶工学、応用物理教育、超伝導、有機分子・バイオエレクトロニクス、プラズマエレクトロニクス、シリコンテクノロジーの10の分科会があり、有料で会員になることができます。それぞれの分野における研究の推進と技術の向上を目的として、さまざまな講演会、研究会、セミナー、スクール、見学会などを積極的に開催しており、会誌・論文誌・会報も発行しております。

各分科会についてのお問い合わせは 本会事務局 上村 までお願い致します。 分科会幹事長及び分科会連絡先（2012年4月1日現在）

日本光学会

• 幹事長：渡辺 正信（産総研）
• URL：http://annex.jsap.or.jp/OSJ/

放射線分科会

• 幹事長：瓜谷 章（名古屋大）
• URL：http://annex.jsap.or.jp/radiation/radiation.html

応用電子物性分科会

• 幹事長：山田 明（東工大）
• URL：http://annex.jsap.or.jp/ohden/

薄膜・表面物理分科会

• 幹事長：山部 紀久夫（筑波大）
• URL：http://annex.jsap.or.jp/tfspd/

結晶工学分科会

• 幹事長：酒井 朗（大阪大）
• URL：http://annex.jsap.or.jp/kessho/

応用物理教育分科会

• 幹事長：塚林 功（日工大共通系物理研）
• URL：http://annex.jsap.or.jp/edu/

超伝導分科会

• 幹事長：圓福 敬二（九大システム情報科学）
• URL：http://annex.jsap.or.jp/support/division/super/

有機分子・バイオエレクトロニクス分科会

• 幹事長：玉田 薫（九大先導物質化学研）
• URL：http://annex.jsap.or.jp/support/division/MandBE/

プラズマエレクトロニクス分科会

• 幹事長：寺嶋 和夫（東大）
• URL：http://annex.jsap.or.jp/plasma/

シリコンテクノロジー分科会

• 幹事長：平本 俊郎（東大生研）
• URL：http://annex.jsap.or.jp/silicon/